Phantoms: entidades sobrenaturales, tales como fantasmas o demonios, que, hasta hace poco, eran consideradas ficticias. Sin embargo, y debido a la propagación de cierto virus, la humanidad pudo ver que dichas criaturas en realidad estuvieron viviendo con nosotros todo este tiempo. Pero eso no es todo. El virus también afectó a la siguiente generación, otorgándoles poderes especiales para luchar contra estos phantoms.

Haruhiko Ichijou y Mai Kawakami son dos ejemplos de esto: mientras que Haruhiko tiene la habilidad de invocar y sellar phantoms, Mai tiene acceso al poder de los elementos. Ellos, junto con la pequeña Ruru, forman el Equipo E de cazadores de phantoms de la escuela Hosea, y su misión será lidiar con los problemas provocados por estos traviesos phantoms mientras descubren los secretos de este intrigante mundo.